Первоначально Бонера не был включен в окончательный состав сборной на чемпионат мира, однако, после того, как основной защитник итальянцев Джанлука Дзамбротта получил травму, находящийся в резерве Бонера был вызван в расположение сборной. В случае если Дзамбротта не сможет восстановиться к старту «мундиаля», Бонера поедет в Германию вместо него.